贝勒医学院(Baylor College of Medicine)的研究人员在一份报告中称，一种乳腺癌细胞系最新公布的基因组序列揭示了一种严重重排的基因蓝图，涉及基因的断裂和融合以及DNA修复机制的断裂在线杂志上。
BCM人类基因组测序中心副教授亚历山大·米洛萨维耶维奇(Aleksandar Milosavljevic)博士说:“这就像一个电脑程序出现了漏洞，变得非常危险。”“它使细胞逃避正常的细胞增殖控制。在实验中，我们发现基因组中的一些重排产生融合基因，使细胞生长不受控制，防止肿瘤细胞死亡，允许它们在正常组织环境外生长。这些都是癌症的基本特征。”
“从我们的角度来看，我们非常确信这些基因组易位可能会成为预后标志，也可能是潜在的治疗目标，”BCM莱斯特和苏史密斯乳房中心副教授、该项目的合作者阿德里安李博士说。两位研究人员都是美国国家癌症研究所指定的丹·l·邓肯癌症中心的研究人员。
Lee说:“这是第一个将这些基因组易位与碱基对解析进行全面比对的研究。”“我认为很明显，Milosavljevic正在研究的技术可能会改变我们对乳腺癌的认识，尤其是乳腺癌的遗传学。”
“使用贝勒医学院开发的这项新技术，很明显乳腺癌对染色体的损害比我们以前想象的要大。首先了解哪些基因发生故障导致癌症，将告诉我们如何最好地治疗癌症，”史密斯乳房中心和邓肯癌症中心主任c·肯特·奥斯本博士说。
研究人员对MCF-7乳腺癌细胞系进行了测序，该细胞系通常用于该疾病的研究。Milosavljevic说，这项对基因组序列的研究将对异常基因组重排的理解细化到碱基对的分辨率水平。
“这就像用显微镜工作，第一次看到了最终的分辨率水平。我们发现了一些被重排的基因，这些基因已知与癌症相关的表型或特性有关。我们发现负责DNA修复的基因被破坏了，这就解释了为什么基因组可能不稳定。”
他们确定了两种类型的基因组不稳定性。一种类型发生在癌症变得具有侵袭性，离开乳管系统并进入周围组织的时候。他说，另一种与基因组本身的低拷贝重复结构有关，这一发现以前与基因组不稳定性无关。
低拷贝数重复暴露了双链DNA修复机制中的一个特殊缺陷。当这不起作用时，基因组就会分裂并再次融合，这种类型是异常的。
李教授说:“虽然只研究了一种细胞系，但事实证明这是有价值的。”
“它提出了一些关于这些重排如何影响细胞DNA修复途径的新想法。我们有一个难题。DNA中的断裂会影响DNA修复蛋白而DNA修复蛋白本来是用来修复断裂的。
他说，研究更多细胞系和单个乳腺肿瘤的计划已经在进行中，以获得有关DNA变化的更完整的图像。
Milosavljevic指出，这项研究是今年出现的几项研究之一。例如，BCM人类基因组测序中心也参与了胶质母细胞瘤(一种脑癌)和肺腺癌的序列测定。所有这些研究都是在美国国立卫生研究院资助的癌症基因组图谱项目的框架下进行的。他说，这些研究以及其他研究证明了这个更加全球化的项目的价值。
Milosavljevic说:“我们这项工作的目的是建立一个基准，以验证下一代测序技术和整个方法，这将导致新的生物学重大发现。”
