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2024-05-05 10:55

基因子网络为乳腺癌提供了新的预后标记

我的通过检查基因ex的亚网络,可以更准确地预测乳腺癌转移或扩散到身体的其他组织病人肿瘤的减压模式,比co常规基因ex根据2008年12月13日至17日在旧金山举行的美国细胞生物学学会(ASCB)第48届年会上的一份报告,

加州大学圣地亚哥分校(UCSD)的科学家Trey Ideker和Han-Yu Chuang说,子网络提供了代表共同功能基因集的新的预后标记,他们与韩国大田的韩国高级科学技术研究所的Eunjung Lee和Doehaon Lee合作。

美韩研究人员利用生物信息学算法对大量乳腺癌妇女的基因表达谱进行分析,确定了这些子网络。

这些数据既包括乳腺癌转移的妇女,也包括肿瘤未扩散的妇女。

然后将基因表达谱映射到先前研究中揭示的人类细胞中信号通路和蛋白质复合物的广泛网络中。

通过搜索数据,研究人员确定了子网络,在这些子网络中,聚集的基因表达模式将不同的患者群体区分开来。

他们还发现了许多与乳腺癌相关的基因,这些基因在以前的基因微阵列图谱中没有被发现。

得益于快速微阵列技术,癌症现在可以根据它们的基因表达或活动模式进行分类。

然而,通过基因表达对疾病进行分类是不精确的,因为从单个肿瘤样本中提取的细胞通常是异质的;在肿瘤某个部位的细胞中开启的基因可能在肿瘤的其他部位没有活性。

此外,在“相同”类型和肿瘤分级的一系列患者中,表达谱可能存在显著差异。

Ideker和Chuang的方法可能会改变诊断,从而使患者的诊断可以超越雌激素反应性乳腺癌,例如,雌激素反应性乳腺癌的特定亚型预后较差或较好。

目前,韩美研究小组正在将这种综合分析方法扩展到白血病、前列腺癌、肺癌等其他癌症。

他们说,他们正在识别信号和转录途径中的“条件反应”基因,这些基因可以用作激活水平的测量,并可以为诊断和预后提供另一种有用的工具。