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2024-05-04 19:55

研究人员发现了癌症中融合的基因

密歇根大学综合癌症中心(University of Michigan Comprehensive Cancer Center)的研究人员利用使人类基因组测序变得更容易的新技术,发现了一系列基因,当它们的染色体相互交换位置时,它们会融合在一起。

这些反复出现的基因融合被认为是导致某些癌症发展的驱动机制。

发现的基因融合物可能有一天会作为诊断癌症的标记物,或者作为未来药物开发的目标。

在发表于《科学》杂志的这项新研究中,研究人员在前列腺癌细胞中发现了几种基因融合。一些基因融合可以在多个细胞系中观察到,而其他基因融合只出现一次。这种融合只在癌细胞中发现,而在正常细胞中没有发现。

“我们在前列腺癌中定义了一类新的突变。反复的融合被认为是癌症的驱动机制。但我们也发现了其他的融合,其中一些对个体患者来说是独特的。我们的下一步是了解这些是否在驱动疾病中发挥作用,”密歇根转化病理学中心主任、密歇根大学医学院sp . Hicks病理学特聘教授Arul Chinnaiyan说。

Chinnaiyan的团队是第一个在前列腺癌中发现染色体重排和融合基因的团队。基因融合在白血病、淋巴瘤和尤因氏肉瘤等血细胞癌中起着重要作用。

在目前的研究中,研究人员表明,更新的技术可以更快、更容易地识别这些基因融合。

研究人员使用了一种称为基因测序的技术,该技术包括创建一个细胞中所有rna的文库。然后测序机一天24小时连续运行数天,读取RNA。一旦测序完成,研究人员就会研究数据,寻找基因融合。

这是一种比Chinnaiyan实验室最初用来识别前列腺癌基因融合的方法更直接的方法,这种方法被称为微阵列。使用微阵列技术,研究人员必须首先知道他们想要看的地方。通过基因测序,研究人员可以在不知道从哪里开始找的情况下找到那里有什么。

“我们现在有能力使用下一代测序技术。这将为癌症研究开辟新的领域,”霍华德休斯医学研究所的研究员Chinnaiyan说。虽然目前的研究重点是前列腺癌,但他的团队也在研究与乳腺癌、肺癌和黑色素瘤有关的基因融合。

研究结果:研究人员测试了基因测序技术,看看他们是否能重新发现以前使用其他技术发现的相同基因融合。除了验证已知的基因融合外,研究人员还发现了一些肿瘤样本中常见的新基因融合。在个别肿瘤样本中发现了其他基因融合。

其他作者:Christopher Maher博士,研究员;Chandan Kumar-Sinha博士,病理学研究助理教授;曹旭红,研究专员;Shanker Kalyana-Sundaram,数据架构师;研究员韩波;Jing Xiaojun, Lee Sam, Terrence Barrette,系统分析师;以及病理学研究助理教授Nallasivam Palanisamy博士

资助:美国国立卫生研究院、国防部和早期检测研究网络