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2024-04-29 06:56

eChIP基因技术用于检测FA蛋白与DNA交联

虽然范可尼贫血(FA)是一种罕见而危险的疾病,但德克萨斯大学安德森癌症中心的一项新实验室研究表明,它可能会为研究人员提供更多常见疾病的线索,包括高度遗传性的乳腺癌。

在9月11日出版的《分子细胞》杂志上发表的一项研究中,科学家们报告说,FA和BRCA癌症蛋白的复制控制了DNA损伤部位的蛋白质招募。

李磊博士是安德森医学中心实验放射肿瘤学教授,也是该研究的通讯作者,他15年的职业生涯中大部分时间都在研究人体如何修复DNA损伤。他说,DNA交联是最严重的DNA损伤类型;它们实际上在某些药物中被用来抗癌,包括顺铂。

答案一直难以捉摸

患有FA(一种遗传性疾病)的人对DNA交联极其敏感,患癌症的风险非常高。范可尼通路是如何保护细胞免受DNA交联的,以及FA蛋白是否直接作用于交联,尽管进行了广泛的研究,但仍不清楚。

“我们的实验室已经研究了近10年,研究为什么FA细胞对交联如此敏感,”李说。“我们已经知道,这一定与它们处理DNA交联的方式有关,但这是我们第一次能够确定其中一些原因。”

FA涉及13个基因;其中任何一种突变都可能导致疾病。其中三个FA基因最近被发现与乳腺癌易感基因BRCA2、BACH1和PALB2相同。

“这让我们开始研究乳腺癌基因,因为我们认为它们可能与DNA交联剂的修复有关,”李说。

研究人员开发了一种新的遗传技术,eChIP,一种基于染色质ip的策略,用于检测具有DNA交联的FA蛋白。

“科学家们多年来一直遵循的模型是,所有13个基因必须一起工作来处理DNA交联,必须有某种级联或连锁反应,”李说。“我们开发了一种新的基因技术,专门研究交联中存在的蛋白质。”

新方法带来答案

使用这种新工具,研究人员发现所有FA基因都存在于交联位点。这是首次在分子水平上将FA蛋白与DNA交联损伤直接联系起来。

“令人惊讶的是,乳腺癌蛋白虽然存在于交联中,但必须在交联中进行DNA复制,”李说。“如果基因组上有DNA损伤,但没有DNA复制,则使用典型的FA蛋白来处理损伤。与乳腺癌相关的FA蛋白正在处理DNA损伤,阻止DNA复制。”

李说,这导致了一种新的范式,即在13个FA基因中必须有两个独立的亚组或亚通路。

“这项研究的主要意义是,现在我们有了一个新的工作模式,”李说。“这为未来乳腺癌蛋白和DNA损伤反应的研究提供了一个新的方向。

“我们的下一步是继续研究FA蛋白和乳腺癌相关蛋白亚群如何帮助保护细胞免受DNA交联损伤。从更广泛的意义上讲,这些细胞机制最终如何帮助我们减少最终导致癌症的突变。”