2023-01-13 05:11

达尔文雀中逆转录病毒的建立和分布的广泛差异

脊椎动物基因组是逆转录病毒代码的存储库,在进化过程中,逆转录病毒作为遗传内源性逆转录病毒沉积到种系中。乌普萨拉大学和普林斯顿大学的研究人员现在提供了关于逆转录病毒在达尔文雀中的建立和分布的新发现。研究结果发表在《自然通讯》杂志上。

研究人员检查了从整个达尔文雀辐射中取样的整个基因组,发现所有个体鸟类中都有共同的内源性逆转录病毒(ERV),这表明大多数逆转录病毒与宿主的相互作用早于宿主物种形成。他们还发现,在不同种群的达尔文雀中,ERV有相当大的变化,这表明逆转录病毒在种系中有更近的定植。自然选择可以导致erv的富集或缺失。雀种间的杂交也会影响其发生,从而导致包括ERVs在内的基因流动。

通过绘制达尔文雀所有物种的ERV变化图,并与相关雀种进行比较,研究人员强调了逆转录病毒-宿主发生的地理和历史模式。

乌普萨拉大学的梅特·莉莉(Mette Lillie)是这项研究的共同第一作者,他说:“ERV沿染色体和染色体之间的分布,以及整个雀种之间的分布,表明ERV与快速物种形成之间的联系。”

作为一个被充分研究的物种群体,达尔文的雀类已经成为进化研究的代名词,它代表了一种自然模型,用于评估在新环境中进行物种形成和殖民的宿主中逆转录病毒活动的程度和时间。

这项研究的负责人、乌普萨拉大学(Uppsala University)的帕特里克·杰恩(Patric Jern)说:“达尔文的雀为将宿主种群中的ERV变异与宿主基因和表型联系起来,为识别历史上的病毒-宿主相互作用和对宿主生物学的潜在贡献提供了一个极好的资源。”